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在海外 上海和广东发现了变异型SARS-CoV-2感染病例 专家表示 没有证据证明它增加了致病性
近日,上海疾控中心对从英国输入的新冠肺炎肺炎确诊病例进行基因测序监测,发现一例病例的SARS-CoV-2基因序列为B.1.1.7亚型,与英国近期报道的突变病毒基因相似。1月2日,广东省疾控中心还在一起从英国输入的确诊病例中发现了一个B.1.1.7突变株,与英国报道的突变病毒高度相似。目前,许多国家已经检测到变异病毒,世卫组织也报告了其他几种变异病毒。
目前如何诊断变异病毒?疾病的传染性增加了吗?很多国家研制的新冠肺炎疫苗有效吗?
1月3日,上海市公共卫生临床中心党委书记、复旦大学附属华山医院传染病科教授卢洪洲在接受红星新闻记者关于这一海外病毒变异的采访时表示,没有证据证明这一海外病毒变异增加了致病性。需要更多的实验室细胞实验和动物实验来进一步证实其传染性。
卢洪洲
是什么促使病毒变异?
免疫脆弱人群或是发生变异关键
SARS-CoV-2突变是什么?卢洪洲认为,病毒变异是指由各种原因引起的病毒遗传物质的变化,如其遗传物质DNA/RNA的碱基突变。化学和物理因素都能诱发各种突变。这些突变往往对病毒有益,如HIV-1病毒,突变率为1/3万。如此高的突变往往会导致耐药性的改变,增加治疗难度,使疫苗难以研制,保护作用减弱。
他补充说,病毒作为最简单的生物,由于其简单的遗传物质结构,更容易变异。这些变异主要发生在基因组增殖和复制过程中。由于免疫压力(如病毒存在的细胞免疫微环境的改变)或病毒特性(如遗传物质复制剪切错误,缺乏准确的复制能力),突变总是会发生。所以突变可以说是病毒应对环境选择的一种策略或生存方式。这种突变在自然环境中是漫长而缓慢的(如形成新的准物种),随着环境压力的增加可以加速。
卢洪洲介绍,从大流行开始,冠状病毒(Sars-CoV-2)一个月就发生一两次变异,国外发现的变异SARS-CoV-2 (B.1.1.7)基因突变率比较快。这种病毒突变的基因编码中有许多不同的基因突变点,包括6个同义突变、3个缺失突变和14个非同义突变,它们的进化离根源还很远。其中,病毒的重要结构蛋白棘蛋白发生了8次基因突变。其中,值得注意的是501Y的突变。V2发生在RBD受体的结合区,导致其与人细胞受体ACE2的结合更紧密。
世卫组织还通报了其他几种变体,如D614G,可使病毒更具传染性;与水貂相关的变体“簇5”可能与减少自然感染或接种疫苗后的免疫保护范围和持续时间有关。VOC 202012/01变种,可使病毒更具传染性。
什么样的环境变化让病毒突变出现?卢洪洲认为,根据《Science》的说法,免疫弱势人群可能是SARS-CoV-2发生重大变化的关键。这些免疫力较弱的人可能为SARS-CoV-2提供了进化谱系的机会,新冠肺炎突变也会加重这些人的原发病。可以说,外界的环境压力,如治疗策略、疫苗策略、宿主自身的免疫环境等,都可能是导致突变的原因。
2020年12月29日,一名戴口罩的男子走过英国伦敦议会大厦。图片来自新华社
此次境外病毒变异有何特点?
扩散范围更广泛,致病性有待研究
目前很多国家都检测到了突变病毒,但是没有报道的国家是否没有病毒突变?卢洪洲表示,并不是说该地区不存在病毒突变,而是检测手段和强度有限。
卢洪洲介绍,与流感相比,流感也是一种呼吸道病毒,在SARS-CoV-2中的变化速度较慢。但这次在国外发现的SARS-CoV-2基因突变中,检测到了大量的突变位点。相比之前SARS-CoV-2中的突变,突变病毒的传播范围也更广。报道称,这种变异病毒的传播率比原毒株高70%,S蛋白与人ACE2受体的结合率也提高了100倍。值得指出的是,这一数据的准确性还需要更多的流行病学调查来准确确定其结果,还需要更多的实验室细胞实验和动物实验来进一步证实其传染性。
病毒突变是否导致疾病加重?对此,卢洪洲认为,到目前为止,SARS-CoV-2中的新突变似乎并没有导致感染者比以前感染该病毒的人患更严重的疾病,也没有证据证明该病毒的新突变导致致病性增加,这还需要更多的研究。目前,即使这些病毒的新突变真的更具传染性,疫情的整体进展也不会改变。
卢洪洲强调,至少在我国持续严格防控疫情的策略下,其对疫情整体进程的影响是乐观的。公共卫生战略中的保护措施和疫苗的推广也影响到这一流行病的整个过程。因此,人们不需要在掉以轻心的同时恐慌。
病毒变异不影响目前的检测方法
但对检测手段提出更多要求
SARS-CoV-2突变怎么诊断?卢洪洲介绍,首先,目前国内主流的核酸检测试剂都是针对双靶基因,即N基因和ORF1ab基因,比单靶基因扩增更有效。目前这种新变异株的S蛋白基因变异出现在国外,剩下的检测手段不会影响核酸试剂的灵敏度和特异性。
“在新冠肺炎大流行期间,来自世界各地的科学家对非典冠状病毒2型的基因组进行了测序。测序方法的不断更新提高了我们对病毒基因组奥秘的理解。”卢洪洲表示,目前,虽然SARS-CoV-2中的常规核酸检测不能单独用于新冠肺炎突变体的鉴别诊断,但从科研和医学诊断的角度来看,病毒突变对检测方法提出了更高的要求。但在常规核酸检测技术-PCR阳性诊断和临床诊断的基础上,通过高通量基因组/转录组测序技术确定SARS-CoV-2的突变特征。通过基因组片段的聚合酶链反应产物的桑格测序进一步验证了突变位点。通过各种检测方法的结合,可以促进对病毒遗传密码的进一步了解。
尚不能确认疫苗对病毒变异无效
仍需做好防护措施
中国的新冠肺炎疫苗已经获准上市,疫苗接种工作已经在北京和上海展开。面对SARS-CoV-2突变,接种疫苗有效吗?对此,卢洪洲介绍,疫苗注射后,人体免疫系统会对整个病毒产生反应,包括产生抗体,甚至动员细胞免疫,达到抗病毒的效果。抗体并不是只针对突变的片段,所以不能确定现有疫苗对该病毒的新突变B.1.1.7无效。更多的实验室结果需要验证,所以我们持积极态度。
据《新京报》报道,中国疾控中心免疫规划首席专家、主任医师王华庆表示,根据世卫组织发布的最新信息,疫苗效果不受病毒变异的影响,世卫组织一直在密切关注这一问题。
卢洪洲表示,从流感疫苗研发过程来看,病毒突变的出现也推动了疫苗研发的不断发展。病毒突变还可以促进更有效和更安全的疫苗不断更新和开发。就目前的情况而言,仍然建议并鼓励人们接种疫苗,以降低感染风险。
那么,面对突变型SARS-CoV-2,如何做隔离和防护呢?对此,卢洪洲表示,病毒变异、什么样的变异会导致疾病加重等重大科学问题,仍需要更多的研究数据来解决。因此,要坚决抵制变异株在更大范围内的传播。他建议人们仍然需要保持严格的身体隔离措施,如保持一定的社交距离,做好个人防护,如旅行时戴口罩,注意手部清洁和消毒。
卢洪洲补充说,对于显著变异,科研水平应积极推进基础研究,医疗诊断技术和培训应不断提高。“早发现、早报告、早隔离、早治疗”的防控体系仍然是阻断疫情传播的有效公共卫生策略。
红星记者张彦良
编辑关力
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